由于战乱扩大，北方士族和中原百姓大批南渡，他们占土地，要特权，与土著的矛盾日益尖锐。为缓和矛盾，王导一方面积极拉拢土著豪门，许以高官厚禄，保证他们的财产身家安全；另一方面又在南方豪族势力较弱的地区设立侨州、侨郡、侨县安置北方士族和移民，使土著与侨民各得其所，使晋室转危为安。
王导提倡勤俭建国，曾指牛首山双峰为天阙，婉转地使晋元帝放弃在都城正南门立双阙、摆威风的主张。因他扶持晋室功勋卓著，所以朝野倾心，号为仲父。晋元帝把他比作管夷吾，亲自对他说："卿，吾之萧何也。"死后赐葬幕府山西南麓。王导与稍后于他的谢安都住在青溪与秦淮间的乌衣巷。唐人刘禹锡游南京，曾感慨赋诗："朱雀桥边野草花，乌衣巷口夕阳斜。旧时王谢堂前燕，飞入寻常百姓家。"